磁性鍋で冷凍ものを温める時は、内袋・トレイ・ラップごと鍋に入れていいですか？

いいえ、内袋・トレイ・ラップなどプラスチックは入れられません。
プラスチックの包材を取り除き、食品だけの状態にして磁性鍋に入れて、電子レンジ加熱してください。

磁性鍋を電子レンジ加熱すると、マイクロ波が波長転換され遠赤外線になります。
鍋の内側は遠赤外線で高熱となりますので、プラスチック製品は磁性鍋に入れないでください。