「マナチュラ」のペレットに黒い点が入っていますが大丈夫ですか？

はい、大丈夫です。
「マナチュラ」に水の中の不純物やミネラルなどが付着して、黒い点のようになることがございます。
そのままお使いいただいて問題ございませんので、ご安心ください。